АО «Национальное агентство по развитию инноваций «QazInnovations», ранее АО «Центр инжиниринга и трансферта технологий», создано в 2003 году постановлением Правительства Республики Казахстан от 1 августа 2003 года № 775 «О неотложных мерах по развитию институционального обеспечения научно-инновационной деятельности, направленных на реализацию Стратегии индустриально-инновационного развития Республики Казахстан на 2003-2015 годы».
Постановлением Правительства Республики Казахстан от 19 июля 2005 года № 742, государственный пакет акций АО «Центр инжиниринга и трансферта технологий» передан в уставный капитал АО «Национальный инновационный фонд», который позже переименован в АО «Национальное агентство по технологическому развитию» и далее в АО «QazTech Ventures».
Таким образом, АО «Центр инжиниринга и трансферта технологий» являлся дочерней организацией АО «QazTech Ventures».
В 2018 году законодательные функции по инновациям предусмотренных Предпринимательским кодексом за исключением развития венчурного финансирования были переданы из АО «QazTech Ventures» в QazIndustry (ранее АО «КИРИ»).
Постановлением Правительства Республики Казахстан от 23 декабря 2019 года № 959, АО «Центр инжиниринга и трансферта технологий» включен в перечень национальных институтов развития в области технологического развития с передачей соответствующих функций от QazIndustry.
В связи с передачей функции по государственной поддержке инновационной деятельности от МИИР РК в МЦРИАП РК, советами директоров АО «QazTech Ventures» и АО «Национальный инфокоммуникационный холдинг «Зерде» (далее – АО «Холдинг «Зерде») принято решение об осуществлении отчуждения 100% акций АО "Центра инжиниринга и трансферта технологий" в пользу АО «Холдинг «Зерде» на основании договора дарения, заключенного 19 февраля 2020 года. То есть, под ведение МЦРИАП РК и АО «Холдинг «Зерде» от КИРИ и МИИР РК перешли штат и функции по инновациям, а от АО «QazTech Ventures» перешло юридическое лицо для осуществление данной деятельности в лице АО «Центра инжиниринга и трансферта технологий» (далее в 2021 году переименован в АО «Национальное агентство по развитию инноваций «QazInnovations»).
В соответствии с внесенными изменениями в Предпринимательский кодекс в конце 2021 года в рамках подписанного проекта закона «О внесении изменении в некоторые законодательные акты по вопросам промышленной политики» Правительство определяет единственного национального института развития в области инновационного развития.
Согласно постановлению Правительства №321 от 20 мая 2022 года АО «Национальное агентство по развитию инноваций «QazInnovations» определен национальным институтом развития в области инновационного развития.
Постановлением Правительства РК №196 от 8 апреля 2022 года АО «НАРИ «QazInnovations» определено Инновационной обсерваторией.
В мае 2023 года права владения и пользования государственным пакетом акций Общества, находящимся в республиканской собственности, согласно постановлению Правительства Республики Казахстан от 5 августа 2022 года № 540 "О некоторых вопросах акционерного общества "Национальный инфокоммуникационный холдинг "Зерде" переданы уполномоченным органом по государственному имуществу (Комитет государственного имущества и приватизации Министерства финансов Республики Казахстан) Министерству цифрового развития, инноваций и аэрокосмической промышленности Республики Казахстан. Право распоряжения государственным пакетом акций Общества, находящимся в республиканской собственности, принадлежит уполномоченному органу по государственному имуществу.
Министерство цифрового развития, инноваций и аэрокосмической промышленности Республики Казахстан осуществляя права владения и пользования государственным пакетом акций Общества является Единственным акционером Общества, представляет интересы государства как акционера по вопросам, отнесенным к компетенции общего собрания акционеров, в соответствии с законодательством Республики Казахстан.
